Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 DMKN-256ENST00000492341 738 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 TUBB6-214ENST00000592683 481 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC42EP1Q00587 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms