Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP2C1P98194 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ATP2C1P98194 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms