Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
FAM3AP98173 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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FAM3AP98173 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
FAM3AP98173 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
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