Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 ZNF423-201ENST00000262383 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 TNFSF13B-201ENST00000375887 2582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 NEK6-213ENST00000540326 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 RNF10-203ENST00000413266 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 ARSK-201ENST00000380009 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 NAGA-201ENST00000396398 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 TPM3-223ENST00000611659 3149 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 ANKMY1-201ENST00000272972 3228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 AC026904.1-201ENST00000430626 3549 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 SHROOM3-201ENST00000296043 11020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 CHCHD7-201ENST00000303759 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 SH3RF2-206ENST00000511217 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 PEG10-203ENST00000488574 2587 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 VPS33B-201ENST00000333371 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 RPGRIP1-213ENST00000557771 3870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 FAM110B-201ENST00000361488 3438 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 ATAT1-205ENST00000376483 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 ALOX5-201ENST00000374391 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 MOG-225ENST00000431798 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 RAB43-205ENST00000393308 4193 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 FP565260.1-201ENST00000617716 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 NUP62-201ENST00000352066 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 FUT6-203ENST00000524754 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 C8B-206ENST00000543257 2382 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 ANKRD26-202ENST00000436985 6827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 C19orf47-208ENST00000582783 3628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 E2F8-205ENST00000620009 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 C12orf74-201ENST00000397833 1856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 BEAN1-207ENST00000564819 2929 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 FAM157A-203ENST00000634862 6083 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 AL449403.1-201ENST00000432783 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 MAST4-202ENST00000403625 10711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 TMEM164-204ENST00000372073 5567 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 EZR-201ENST00000337147 3068 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 RBMX-201ENST00000320676 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 AC011899.1-201ENST00000436489 3600 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 MMP19-206ENST00000548629 1813 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 SEPT4-223ENST00000583114 1709 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 MARCH5-201ENST00000358935 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 TRAK1-206ENST00000449246 3260 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 UCK1-202ENST00000372210 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 CYP1A1-202ENST00000395048 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 ERCC2-204ENST00000391945 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 SNRK-201ENST00000296088 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 NRF1-201ENST00000223190 2424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 CDK5RAP1-201ENST00000339269 1891 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 SMG6-201ENST00000263073 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
NKX2-5P52952 CDH5-208ENST00000614547 3779 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.8 ms