Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TMPOP42166 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TMPOP42166 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms