Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTGFP29279 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 KLK8-203ENST00000347619 555 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 MED27-202ENST00000357028 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 FANK1-203ENST00000368693 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 DHRSX-IT1-201ENST00000437244 651 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 IGKV3-11-201ENST00000483158 392 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AC010395.2-201ENST00000509899 904 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AC008808.2-201ENST00000510349 569 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 STMN4-203ENST00000519614 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 SMCO4-202ENST00000525141 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AC025259.1-201ENST00000550301 647 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 PIGH-210ENST00000560722 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AL590094.1-206ENST00000635959 478 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AL590094.1-209ENST00000637260 499 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 CCDC42-201ENST00000293845 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 CACYBPP3-201ENST00000406011 625 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 NOS2P3-201ENST00000411468 867 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AC004910.1-201ENST00000433493 787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 CHN2-214ENST00000439711 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 FHIT-205ENST00000476844 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AC108112.1-201ENST00000505567 659 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 TOB1-AS1-202ENST00000514358 690 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AL583722.3-201ENST00000553433 503 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 LINC01137-201ENST00000424989 1395 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTGFP29279 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms