Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 SLC4A5-205ENST00000394019 6348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
HOXA3O43365 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
HOXA3O43365 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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