Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 RYR1-202ENST00000359596 15117 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 MYRIP-203ENST00000425621 2981 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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ARL2-SNX15V9GYD0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35F1-201ENST00000360388 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 PRRG4-201ENST00000257836 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 UMPS-201ENST00000232607 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR62-203ENST00000401500 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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ARL2-SNX15V9GYD0 GPR37L1-201ENST00000367282 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RASAL2-201ENST00000367649 4378 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SMCR8-201ENST00000406438 8279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD17-202ENST00000358602 10784 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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