Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 U73169.1-201ENST00000395152 367 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PLXND1Q9Y4D7 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms