Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 MGRN1-211ENST00000588994 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 SNRNP27-201ENST00000244227 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MCMBPQ9BTE3 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MCMBPQ9BTE3 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 294 ms