Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 EFHC1-221ENST00000636489 2421 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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LMO3Q8TAP4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 ZCCHC12-201ENST00000310164 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LMO3Q8TAP4 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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