Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
IMPG1Q17R60 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 CACNA2D2-205ENST00000429770 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ABCA3-202ENST00000382381 6446 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 GALNT7-201ENST00000265000 4307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
IMPG1Q17R60 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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