Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AL121972.2-201ENST00000431108 556 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC006042.1-201ENST00000449931 524 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC007292.3-201ENST00000594776 357 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms