Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PTPRJQ12913 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRJQ12913 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRJQ12913 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRJQ12913 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRJQ12913 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRJQ12913 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRJQ12913 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRJQ12913 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRJQ12913 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRJQ12913 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRJQ12913 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRJQ12913 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRJQ12913 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRJQ12913 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRJQ12913 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRJQ12913 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRJQ12913 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRJQ12913 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRJQ12913 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRJQ12913 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRJQ12913 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRJQ12913 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
PTPRJQ12913 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PTPRJQ12913 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.6 ms