Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZBED6P86452 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms