Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN10P78369 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 HOXB-AS3-209ENST00000477144 743 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 RBM25-204ENST00000526754 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN10P78369 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms