Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 GRID2-201ENST00000282020 6117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PLEKHM1P1-205ENST00000582986 5014 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 HDAC7-202ENST00000354334 4065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 HDAC7-201ENST00000080059 4095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CDH8-201ENST00000299345 3728 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 NMNAT2-201ENST00000287713 5663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 REST-208ENST00000619101 7114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 AC012313.8-201ENST00000595059 5402 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 FBXO22-201ENST00000308275 10725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 LRPPRC-201ENST00000260665 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HERVK_113P63121 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms