Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPC3P51654 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms