Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCAMP43121 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCAMP43121 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCAMP43121 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
MCAMP43121 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCAMP43121 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCAMP43121 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MCAMP43121 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MCAMP43121 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MCAMP43121 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MCAMP43121 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MCAMP43121 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MCAMP43121 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MCAMP43121 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
MCAMP43121 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MCAMP43121 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MCAMP43121 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MCAMP43121 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MCAMP43121 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 COASY-202ENST00000421097 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MCAMP43121 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MCAMP43121 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms