Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

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Length 766 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
BRAFP15056 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
BRAFP15056 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
BRAFP15056 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BRAFP15056 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BRAFP15056 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BRAFP15056 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BRAFP15056 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BRAFP15056 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BRAFP15056 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BRAFP15056 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BRAFP15056 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
BRAFP15056 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
BRAFP15056 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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