Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 TAGLN3-205ENST00000478951 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXD8P13378 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms