Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 SPAAR-203ENST00000636776 1538 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 AC078785.1-204ENST00000460707 764 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM10L2BP0DMW5 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms