Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AL358781.1-202ENST00000321081 1360 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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CLDN9O95484 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
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CLDN9O95484 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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CLDN9O95484 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CLDN9O95484 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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