Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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C9orf172C9J069 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf172C9J069 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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C9orf172C9J069 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf172C9J069 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf172C9J069 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf172C9J069 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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C9orf172C9J069 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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C9orf172C9J069 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf172C9J069 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf172C9J069 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf172C9J069 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
C9orf172C9J069 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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C9orf172C9J069 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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C9orf172C9J069 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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C9orf172C9J069 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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C9orf172C9J069 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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C9orf172C9J069 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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C9orf172C9J069 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C9orf172C9J069 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
C9orf172C9J069 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
C9orf172C9J069 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C9orf172C9J069 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
C9orf172C9J069 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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