Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 ENDOV-203ENST00000517795 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 DDX12P-201ENST00000432996 2947 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 CDC20-201ENST00000310955 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 DPYSL5-207ENST00000614712 5128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 SYNJ2-208ENST00000640338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CCDC66A2RUB6 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms