Protein–RNA interactions for Protein: Q9QC07

ERVK-18, Endogenous retrovirus group K member 18 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-18Q9QC07 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVK-18Q9QC07 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVK-18Q9QC07 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVK-18Q9QC07 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVK-18Q9QC07 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVK-18Q9QC07 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVK-18Q9QC07 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVK-18Q9QC07 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVK-18Q9QC07 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVK-18Q9QC07 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVK-18Q9QC07 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVK-18Q9QC07 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVK-18Q9QC07 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVK-18Q9QC07 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVK-18Q9QC07 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVK-18Q9QC07 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVK-18Q9QC07 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVK-18Q9QC07 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVK-18Q9QC07 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVK-18Q9QC07 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVK-18Q9QC07 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
ERVK-18Q9QC07 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 POLDIP3-209ENST00000617178 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ERVK-18Q9QC07 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms