Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LRIT1Q9P2V4 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms