Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CCDC88CQ9P219 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CCDC88CQ9P219 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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CCDC88CQ9P219 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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CCDC88CQ9P219 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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CCDC88CQ9P219 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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