Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC102BQ68D86 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms