Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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CCDC142Q17RM4 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CCDC142Q17RM4 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CCDC142Q17RM4 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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CCDC142Q17RM4 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CCDC142Q17RM4 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CCDC142Q17RM4 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CCDC142Q17RM4 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CCDC142Q17RM4 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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