Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 ATP5H-202ENST00000344546 553 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 KRTAP10-9-201ENST00000397911 1171 ntAPPRIS P2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 CDK4P1-201ENST00000454213 828 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 ERP29-202ENST00000455836 1333 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
SRSF5Q13243 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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