Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRJQ12913 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRJQ12913 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRJQ12913 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRJQ12913 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRJQ12913 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRJQ12913 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRJQ12913 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRJQ12913 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRJQ12913 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRJQ12913 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRJQ12913 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRJQ12913 VASH1-AS1-202ENST00000556072 1684 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRJQ12913 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRJQ12913 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRJQ12913 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRJQ12913 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRJQ12913 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRJQ12913 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRJQ12913 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRJQ12913 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRJQ12913 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PTPRJQ12913 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PTPRJQ12913 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 335.5 ms