Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 NRP1-202ENST00000374816 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 PPP2R2C-204ENST00000506140 1780 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 ACER1-201ENST00000301452 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
MCCD1P59942 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 ING4-201ENST00000341550 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 LDLRAD3-202ENST00000524419 1996 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 NAALADL1-201ENST00000340252 2376 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 CHMP4C-201ENST00000297265 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 GDA-203ENST00000376986 1771 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
MCCD1P59942 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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