Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 AC019205.2-203ENST00000421315 3362 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 VRK3-209ENST00000594948 1847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 CLIC4-201ENST00000374379 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms