Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ITGAEP38570 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAEP38570 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAEP38570 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAEP38570 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAEP38570 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAEP38570 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGAEP38570 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAEP38570 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAEP38570 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAEP38570 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGAEP38570 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAEP38570 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGAEP38570 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAEP38570 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAEP38570 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGAEP38570 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAEP38570 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ITGAEP38570 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAEP38570 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAEP38570 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAEP38570 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAEP38570 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAEP38570 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAEP38570 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAEP38570 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAEP38570 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAEP38570 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAEP38570 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAEP38570 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ITGAEP38570 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ITGAEP38570 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.5 ms