Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GJB2P29033 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJB2P29033 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GJB2P29033 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJB2P29033 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJB2P29033 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJB2P29033 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJB2P29033 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJB2P29033 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GJB2P29033 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJB2P29033 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJB2P29033 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJB2P29033 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 RTN3-210ENST00000540798 3124 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB2P29033 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB2P29033 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms