Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 TNNT2-201ENST00000236918 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 RHCE-203ENST00000346452 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AL021407.3-201ENST00000407522 486 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 WASIR2-201ENST00000527434 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AP000439.1-201ENST00000544004 581 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 LINC00662-204ENST00000588027 562 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AC245884.8-201ENST00000599382 880 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AC092687.3-201ENST00000606907 393 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AC010776.3-201ENST00000617349 424 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 BSDC1-209ENST00000526031 1361 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 MAFTRR-201ENST00000562921 1859 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 DNPEP-205ENST00000373972 1578 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 BTN2A2-204ENST00000432533 1570 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 FXYD2-201ENST00000260287 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AC002066.1-201ENST00000446355 514 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 TMEM161B-AS1-204ENST00000504636 1039 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 DHRS7-202ENST00000536410 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AC069503.1-201ENST00000538710 816 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AC005336.1-201ENST00000585431 1243 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 GUCY1A3-213ENST00000621234 1788 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 MTA3-204ENST00000406911 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 MKRN7P-201ENST00000433469 1371 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 OLFML1-204ENST00000530135 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 OR6N1-201ENST00000335094 1027 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 TGFA-206ENST00000445399 812 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 COL18A1-AS2-201ENST00000446475 552 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AC006372.1-201ENST00000449903 546 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AC079601.2-201ENST00000547729 775 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AC127496.5-202ENST00000572036 869 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AP001180.4-201ENST00000584167 823 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AC117500.5-201ENST00000623233 527 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 FAM90A22P-201ENST00000400142 1395 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 FKBP4P7-201ENST00000433874 1363 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 GMEB1-201ENST00000294409 1912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 CDA-201ENST00000375071 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRMP28827 AP001341.1-201ENST00000409758 763 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms