Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLD1P28340 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 SMIM4-201ENST00000307106 274 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 FAM86FP-201ENST00000338711 969 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ZBTB46-AS1-201ENST00000435912 533 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 Z69733.1-201ENST00000445990 632 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 CDHR4-205ENST00000487256 1017 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC079340.2-201ENST00000504957 495 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 DDIAS-204ENST00000525388 961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AL139317.2-201ENST00000556998 158 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 MIR6165-201ENST00000614803 84 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ADORA3-204ENST00000632535 1201 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC245369.8-201ENST00000636589 306 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLD1P28340 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 MB-204ENST00000401702 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC098649.1-201ENST00000427258 569 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC004923.1-201ENST00000527543 776 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC005920.4-201ENST00000573301 492 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 MIR4309-201ENST00000582498 83 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 LUC7L3-223ENST00000625349 408 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC012594.1-273ENST00000626618 816 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC008993.3-201ENST00000633603 631 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 CFAP20-201ENST00000262498 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
POLD1P28340 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms