Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMG20BQ9P0W2 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMG20BQ9P0W2 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMG20BQ9P0W2 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMG20BQ9P0W2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HMG20BQ9P0W2 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMG20BQ9P0W2 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMG20BQ9P0W2 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMG20BQ9P0W2 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMG20BQ9P0W2 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMG20BQ9P0W2 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMG20BQ9P0W2 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMG20BQ9P0W2 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMG20BQ9P0W2 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMG20BQ9P0W2 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMG20BQ9P0W2 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMG20BQ9P0W2 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HMG20BQ9P0W2 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
HMG20BQ9P0W2 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HMG20BQ9P0W2 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms