Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 MCOLN3-201ENST00000341115 1762 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 INCA1-201ENST00000355025 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 LINC02433-202ENST00000507108 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 AP001596.1-201ENST00000429340 781 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 AC133555.4-201ENST00000569081 152 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 SMIM28-201ENST00000573100 855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 AC008622.3-201ENST00000621170 600 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 NR1I2-206ENST00000638727 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 PAX5-204ENST00000377852 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 CASP8-212ENST00000432109 1629 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 TP63-206ENST00000392463 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 UBE2A-206ENST00000625938 1381 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 FTHL17-201ENST00000359202 813 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 AC113398.1-201ENST00000464124 406 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 CSRP2-207ENST00000552330 910 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 AC005736.3-201ENST00000571169 244 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 FXYD4-204ENST00000616495 778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN18Q99952 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms