Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 ELP2-221ENST00000542824 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 RASA4-203ENST00000461209 3244 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 FGGY-201ENST00000303721 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 NIT1-202ENST00000368008 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 FGF10-AS1-201ENST00000502457 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CHP1Q99653 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms