Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms