Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 RNU1-80P-201ENST00000459500 161 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 RN7SL134P-201ENST00000579756 303 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STRIP1Q5VSL9 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
STRIP1Q5VSL9 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms