Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 HPCAL4-201ENST00000372844 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms