Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 BCL11A-204ENST00000359629 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 MCEE-201ENST00000244217 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 FAM209A-201ENST00000371328 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC048382.1-201ENST00000542197 1018 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AL035422.2-201ENST00000603059 565 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AL513283.1-203ENST00000640010 891 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 GPR15-201ENST00000284311 1252 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 LGALS14-201ENST00000360675 773 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CAMK2BQ13554 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC14□□□□□ -0.17
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