Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 B4GALT4-201ENST00000359213 2385 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 MYO16-203ENST00000357550 6779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 CPEB1-213ENST00000617462 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBASH3AP57075 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms