Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 COG1-201ENST00000299886 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 STAT3-203ENST00000404395 2633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 CYFIP2-219ENST00000616178 4210 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 NUDT9-203ENST00000473942 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 ESRRAP2-203ENST00000453309 822 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 NFATC2IP-206ENST00000568148 1157 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 RBM4-201ENST00000310092 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 STRCP1-201ENST00000509801 5328 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 DRD2-208ENST00000542968 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
POLR2KP53803 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms