Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
APOBEC1P41238 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms