Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPB2P35606 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPB2P35606 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPB2P35606 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms