Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ERVV-2B6SEH9 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 BPIFA4P-201ENST00000375465 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF10A-204ENST00000613472 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 HRH2-202ENST00000377291 2561 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms